福州南站到东南眼科没有直达地铁，但可以乘坐地铁1号线到福州火车站，然后转乘公交车或出租车前往东南眼科。原因是福州南站所在的地铁2号线目前还未开通，而福州火车站距离东南眼科较近，可以选择其他交通方式前往。