新海港码头和粤海铁路南港均位于海南岛，二者的区别如下：

- 用途不同：新海港码头主要用于海运方面的交通，对于需要海运的货物比较方便；粤海铁路南港是火车轮渡码头，火车到达港口后被拆解上船，到达对岸（徐闻县粤海铁路北港）后再开出来，被称为“隐形铁路”。

- 交通方式不同：新海港有高速铁路、普速铁路、地铁等多种交通方式；粤海铁路南港有汽车轮渡业务。

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