北京南站到大兴机场正常情况下不进过昌平区。

北京南站位于北京市区南二环外，属于丰台区；大兴机场位于北京市南面远郊区，属于大兴区。正常情况下，从北京南站一路向南，即可到达大兴机场，途径丰台区和大兴区。而昌平区位于北京市区北五环以外，正常情况下不会经过。

南站距离大兴机场不远，都在北京南边，昌平在北边，所以不经过