高考体检有异议的申请复检流程涉及多个步骤，具体如下：

提出申请：考生首先需要向当地招办提出专项复检的书面申请，并填写《高考体检专项复检申请单》。这一步骤是启动复检流程的起点。

审核与登记：当地招办与体检机构审核申请后，分别在申请单上签字盖章。随后，考生凭申请单和空白体检表到省招办办理专项复检审核登记手续。

专项复检：考生随后需凭加盖专用章的复检体检表到指定的终检医院进行专项复检。负责专项复检的主检医师在核实复检申请单和考生身份后，按程序对需复检的项目进行复检。

结果更正：考生带已复检的体检表及有关体检单据到省招办办理体检信息更正手续，以确保体检信息的准确性。

终检仲裁：如果考生对复查结果仍有异议，由省招生委员会指定的终检医院负责对有异议的体检结果做出仲裁结论。复查和仲裁工作须于规定时间内完成。

这一流程旨在确保高考体检结果的准确性和公平性，给予考生对体检结果有异议时的申诉机会。不同地区可能会根据当地的具体情况有所调整，但基本流程和原则是相似的。