汕头港口填平的原因是：汕头市拥有人口500多万，是全国人多地少的典型地区，在不影响汕头港码头功能区的前提下，对东海岸浅海滩片区进行填平，增加城市土地面积。

2023年汕头市对东海岸浅海滩片区进行填平，增加城市土地面积，所以进行高铁绕路、飞机改道、港口填平。