学校办学历史溯源于1979年成立的北京市经委职工教育师资进修学校，1984年更名为北京市经济管理干部学院。

2003年，河北远东职业技术学院（原华北石油职工大学）划转并入北京市经济管理干部学院；同年，原国家经贸委在北京市经济管理干部学院挂牌成立北京经理学院。

2006年，学校转制为普通高等学校，更名为北京经济管理职业学院。

2012年10月，学校隶属关系由市国资委转至市教委。