海口码头有海口港（新海港、秀英港、马村港区）和南港。其中可以运输旅客、客车、小车的轮渡有新海港、秀英港和粤海铁路南港码头，货运港为马村港区。

共有海口秀英港，海口新港，海口粤海铁路南港