有区别。

赔1000元说明交通事故较小，因为交强险的财产保险最高赔2000元，没有大的损失，或人员受伤。无责任医疗费用赔偿限额为1000元；

要是赔到3500元就说明涉及到人员受伤，致使受害人遭受人身伤亡或者财产损失了，依法应当由被保险人承担的损害赔偿责任，保险人按照交强险合同的约定对每次事故在下列赔偿限额内负责赔偿

没有，没有区别，车险理赔主要取决于理赔次数。另：尽量不要出险太多次，不然第二年保费会贵很多，一般赔付不是很多的话就不要找保险公司理赔了，当然一次理赔和两次理赔原则上第二年车险价格是一样的