注销他项权证要收费。

《城市房屋权属登记管理办法》第二十五条规定，有下列情形之一的，登记机关有权注销房屋权属证书：

(一)申报不实的;(二)涂改房屋权属证书的;(三)房屋权利灭失，而权利人未在规定期限内办理房屋权属注销登记的;(四)因登记机关的工作人员工作失误造成房屋权属登记不实的。注销房屋权属证书，登记机关应当作出书面决定，送达当事人，并收回原发放的房屋权属证书或者公告原房屋权属证书作废。