端本清源是一个成语，意思是从根本上加以整顿清理。

端，端正，清理；本，根本；清，清除不纯成分； 源，根源。指从根本上加以整顿清理。出自宋朝朱熹《答龚参政书》：“端本清源，立经陈纪，使阴邪退听。”