有影响。

有些地方是必须要到科三约考试之前补齐科二的补考费才能预约下一科目，有些地方要等到科目四考完之后，在车管所取证时补齐之前驾照考试过程中所有的费用，不补齐之前欠缺的费用，车管所不颁发驾驶证。