利用超声波捕鱼器通过换能器，发出强劲超声波能量，造成水生物的脑部暂时空化昏迷，体积越大，受到的影响就越深，因而，越大的鱼越容易捕。

通过调节输出能量，达到捕大留小的目的。也正是这个原因，海中的鲸鱼常常因潜艇发出的超强超声波影响，而导致死亡。