不会扣分。

如果考生对自己专转本的成绩有所异议可以申请进行成绩复核,成绩复核一定是有用的。如果在公布成绩后发现自己的成绩与预期成绩有较大差距，可以向推荐学校提出核查成绩的书面申请。推荐学校须在规定时间内，通过“专转本”网上综合管理系统上传考生名单，省教育考试院统一组织复核，复核结果通过推荐学校回复考生。