专升本的档案应该妥善保管，以备日后参加工作或升学时使用。

首先，应将证书、成绩单等重要文件进行归档，避免遗失或损坏。其次，应定期备份电子档案，以免意外情况导致数据丢失。同时，应注意保护个人隐私，避免档案泄露。最后，应及时更新档案，记录自己的学习和工作经历，以便更好地展示自己的能力和成就。