南京工业大学有3个校区,分别是丁家桥校区、虹桥校区和江浦校区。

丁家桥校区：江苏省南京市鼓楼区新模范马路5号。该校区的院系有电气工程与控制科学学院、能源与动力工程学院、自动化学院、管理学院、外国语学院等多个学院和系。虹桥校区：中山北路200号。该校区的院系有自动化学院、机械工程学院、物流工程学院、电子信息工程学院、等多个学院和系。江浦校区：江苏省南京市浦口区浦珠南路30号，该校区的院系有轻工科学与工程学院、机械工程学院、数理学院、信息工程学院、经济管理学院、材料科学与工程学院、等多个学院和系。