苏州大学医学院的综合实力要好于安徽医科大学。

苏州大学苏州医学院办学历史长，学科学术研究水平和教学研究质量优良，且建有各级的教学实践基地，安徽医科大学也是一所有一定声望的医科大学，办学质量也较为优良，但从两校学科水平看，除预防医学安医好于苏大外，临床医学、基础医学、医学影像技术等学科，安医均比苏大要弱一点。