吉安市目前有两所高等学校，分别为江西理工大学吉安校区和吉安职业技术学院。

江西理工大学是一所综合性大学，设有工、理、管、文、法、教育、艺术等多个学院，其中吉安校区是江西理工大学的分校区，主要开设工程类、理学类和管理类专业。吉安职业技术学院则是一所以培养高技能人才为主的职业教育学院，开设有多个专业，如机电技术、汽车维修、餐饮管理等。