科目三五次挂科重新建档应该重新考试，重新考试的意思是从科目一开始考试。

因为根据我国规定的驾考准则来说，科目一跟科目四可以没有限制的去考，而科目二跟科目三只有五次考试的机会，每次考试再加一次补考的机会，一共十次考试。如果五次全部挂科就需要从新开始考。