好几条轨道线都穿城(主城区区域)而过。

2号线(骑跨式单轨)，从巴南区渔洞，经过大渡口区，九龙坡区，终到渝中区较场口(解放碑)。

1号线(地铁)，从渝中区朝天门，经过九龙坡区，沙坪坝区，终到璧山区。

3号线(骑跨式单轨)，从巴南区渔洞，经过南岸区，渝中区，江北区，渝北区火车北站，终到江北机场T2航站楼。

10号线(地铁)，从江北区红土地，经过渝北区火车北站和机场T3航站楼，终到渝北区王家庄。环线(地铁)，连接了沙坪坝区(火车西站)，九龙坡区，南岸区，江北区，渝北区(火车北站)。

5号线(地铁)，分南北运行。北线从江北区大石坝，到渝北区园博园。南线从九龙坡区石桥铺，经过沙坪坝区火车西站，到九龙坡区跳蹬，即将延长至江津区。

重庆李子坝轻轨站因为地铁穿楼的魔幻景色成为网红打卡热点,位于重庆轨道交通2号线。