上海商住房满40年产权该怎么办？住宅建设用地使用权期限届满的，自动续期。

续期费用的缴纳或者减免，依照法律、行政法规的规定办理。非住宅建设用地使用权期限届满后的续期，依照法律规定办理。该土地上的房屋以及其他不动产的归属，有约定的，按照约定；没有约定或者约定不明确的，依照法律、行政法规的规定办理。

上海商业产权的房屋40年后土地使用权到期，你需要向土地管理部门缴纳土地出让金具体的计算方法，根据国家的相关规定执行。