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尿素循环主要由5步反应构成。
首先,氨与二氧化碳在氨甲酰磷酸合成酶的作用下生成氨甲酰磷酸,这一过程需要消耗2分子的ATP,之后,氨甲酰磷酸与鸟氨酸在鸟氨酸转氨甲酰酶作用下生成瓜氨酸。然后,瓜氨酸在精氨琥珀酸合成酶的作用下与天冬氨酸发生缩合反应,生成精氨琥珀酸,这一过程需要消耗一个ATP中的两个高能磷酸键。精氨琥珀酸可以裂解为精氨酸和延胡索酸。最后,精氨酸被精氨酸酶水解为尿素和鸟氨酸。经过这一循环生成尿素,相当于消耗了4个ATP。