合肥工业大学四大王牌专业有金融工程、思想政治教育、信息与计算科学。

其他还有机械设计制造及其自动化、车辆工程、测控技术与仪器、金属材料工程、电气工程及其自动化、电子信息工程、自动化等，可以算得上是最好的一些专业了。