大学自动退学后学籍由教务处暂时管理，不会被注销。

学籍是指某一学生属于某一学校在法律上的身份和资格，拥有学籍的学生可以获得该校提供的教学资源，并在该校完成学业取得学历证书。对于中途由于各种缘故退学的学生，可以根据自身的情况选择申请复学或者将学籍从原来的学校转到其他学校就读。

按道理来说是不应该注销的，因为学籍是一个学生在这个学校接受教育的资格，如果是在中途因某种原因退了学但学籍还是保留在这个学校，学生可以自己来把学籍转走。