南京林业大学比较好的专业有林业工程、林学、风景园林学、轻工技术与工程、农林经济管理、机械设计制造及其自动化、森林工程、林产化工、木材科学与工程、土木工程等1。

此外，南京林业大学植物与动物科学、农业科学、环境/生态学、生物与生化、材料科学、工程科学、化学专业进入ESI全球前1%学科排名1。