苏州科技大学应用化学专业的专业代码是48。

专业代码是高校为了标识和管理不同专业而设立的一种编号系统。每个专业都有一个独特的代码，方便学校和相关部门进行录取、管理和统计。在苏州科技大学，应用化学专业的专业代码被确定为48，这也是该专业的唯一标识符。