军校专业主要分为三类，分别为指挥类专业、非指挥类专业、合训分流专业，指挥类专业是为各军兵种培养军事指挥管理人才，非指挥类专业培养为部队、军校培养专业技术人才，合训分流是培养懂技术、会管理、能指挥的复合型初级指挥军官。

军校专业在类别上分为指挥类军校专业和技术类军校专业，两种类型的军校专业名字相同，但是在培养目标和毕业就业岗位的分配上有所区别。