财务总监与总会计师的区别是做的企业性质不同，通常情况下，财务总监主要适用上市公司，民营企业等组织，会计师主要是适用于国有企业，此外，他们的职责稍有不同，财务总监一般行使的是财务副总经理的职务，总会计师分管财务工作的范围相对较小一些。