首先是词性不一样。

是表示事物存在，是动词，表示具备；而由字是介词，有与从字相近的作用，表示时间、地点和方向去施行或接受；例如；这事由为去办。其次，用法不一样：可以单独与别的事物构成完整的一句话回而由不能，要组成介词结构才行。