广州市轻工是管辖广州市的轻工单位，而广东轻工是省属单位，管辖广东全省的轻工单位，同时也包括了广州市的轻工单位。

所以在管辖权限上是不同，级别也不同，一个是市属，一个是省属。广州轻工有广州造纸厂，珠江啤酒厂等等单位，而广东轻工有广州轻工技术学院等等单位。