重庆市委、市政府还委托两江新区管委会管理重庆保税港区集团、市江北嘴投资集团、重庆悦来投资集团在两江新区范围内开发管理区域（区域面积约69平方公里），以及重庆港务物流集团的果园港、寸滩港区的经济发展、开发建设等区域行政管理工作。