公交中山通并不会扣除会员费。

中山通是一种智能卡，用户可以在公交、地铁等交通工具上使用，方便快捷。用户需要先购买一张中山通卡，并在卡上充值，可以选择不同的充值方案。但是中山通并不会自动扣除会员费，用户需要自行管理自己的卡余额和充值。如果用户需要享受中山通会员的优惠政策，需要在相应的渠道进行申请和缴费。