井水做米饭发暗可能有几个原因。

首先，井水中可能含有较高的铁、锰等金属离子，这些离子会与米中的淀粉结合，导致米饭发暗。其次，井水中可能含有较高的有机物质，如腐殖酸等，这些物质会与米中的淀粉发生反应，使米饭变暗。此外，井水中的微生物和细菌也可能导致米饭变暗，因为它们会分解米中的营养物质，影响米饭的颜色。为了避免米饭发暗，可以选择使用经过过滤和净化的水，或者使用矿泉水或纯净水来煮饭。