南京的211研究生院校包括南京大学、东南大学、南京航空航天大学、南京理工大学、河海大学、南京农业大学、中国药科大学和南京师范大学。

这些高校都是中国教育部认定的重点大学，它们在各自的领域和专业中具有较高的教学和研究水平。具体如下：

1. 南京大学：作为中国的顶尖大学之一，南京大学在人文社科、自然科学等多个领域都有深厚的学术积累和研究成果。

2. 东南大学：东南大学以工程学科著称，同时在建筑学、医学等领域也有显著成就。

3. 南京航空航天大学：该校在航空航天及相关工程技术研究领域具有较强的实力。

4. 南京理工大学：南京理工大学在材料科学、化工与制药等领域有特色和优势。

5. 河海大学：河海大学以水利工程闻名，同时在水资源、环境科学等方面有独到的研究。

6. 南京农业大学：南京农业大学在农业科学、生命科学等领域具有突出的研究和教学成果。

7. 中国药科大学：中国药科大学是国内药学教育和研究的重要基地。

8. 南京师范大学：南京师范大学在教育学、心理学等师范教育领域有深厚的背景。需要注意的是，这些排名可能会随着时间的推移而发生变化，因此建议关注最新的官方评估报告或相关教育资源获取最新信息。

南京大学、东南大学、南京航空航天大学、南京农业大学、河海大学、南京师范大学。