独立院校建档立卡可以免学费，但具体情况需视院校政策而定。

1. 根据国家政策，建档立卡学生可以享受免学费政策，而独立院校和公立院校并没有区别。

2. 但是，不同独立院校针对建档立卡学生的补助政策和具体实施情况并不一样，有些独立院校会通过奖学金、助学金等形式给予帮助，但不一定能够免去全部学费。

3. 因此，具体问题需要具体分析，需要查阅该独立院校的政策和具体情况来判断学费是否免除。

不管上民办大学，公办大学都免学费。

建档立卡户可以享受免学费的政策，而且能享受的其他政策支持也有很多。很多的学校会对建档立卡户的同学提供各种补助，以减轻这些贫困家庭供养孩子上学的教育经费，所以不用担心上学费钱的问题。