专利申请费用应当计入公司的研发支出科目、管理费用科目。

且申请专利的费用包括专利的申请费、申请附加费、公布印刷费；专利登记费、公告印刷费、年费等费用。如果形成了一个专利，那么则计入无形资产核算；如果没有形成企业的一个专利，那么则直接计入管理费用核算；如果是为企业研发某个科研项目而申请的专利费用，可做到研发支出科目，最后结转到管理费用科目。