2006年，滨州学院飞行技术专业经教育部和中国民用航空局批准设置，填补了山东省内高校民用航空类专业空白。

飞行学院先后获得中国民用航空局颁发的ATPL理论培训机构资质、民用航空器驾驶员执照理论考点资质、民用航空器维修培训机构资质、民用航空器维修人员执照考点资质。

2019年中国校友会发布的中国大学排行榜中，飞行技术专业被评为4星级，属于中国高水平专业，位列全国第5位。