全国卷理综分数分配方式是按照学校参考人数比例进行分配的。

原因：首先，全国卷理综考试的考生非常多，参考人数会根据学校的实际报名人数进行比例分配。其次，为了公平公正，各个学校参加人数不同的情况下，采用比例分配的方式最能保证各个学校的参考人数得到公平的对待。全国卷理综考试是高考中的一项重要考试，分值占到总分的30%，对考生来说非常重要。为了公正地分配成绩，教育部门采用比例分配的方式，确保学校之间没有歧视和偏差。此外，考生在备考过程中，一定要注重课堂学习和实践探究，提高自己的理综实际操作能力，才能在考试中取得理想的分数。