1、缺点是随着垂直管理部门的增加，这些部门原本存在的税收流失、数据造假、环境恶化、生产安全等问题反而愈加凸显。

这意味着以削弱监督为代价提高行政效率的改革面临着另一个严峻的挑战。

2、优点是实行部门垂直管理，在增强中央宏观调控能力，消除地方保护主义，保证政策法律贯彻落实中发挥了一定的作用。