食品工程学院的专业包括食品科学、制糖工程、生物技术与食品工程、农产品加工及贮藏工程、营养与食品卫生学、生物化学与分子生物学、粮油、油脂及植物蛋白工程、水产品加工及贮藏工程、食品科学与工程、食品质量与安全。