银行询证函填写的金额是被审计企业在银行的各类账户余额。

银行询证函是会计师事务所在执行审计过程中，以被审计企业名义向银行发出的，用以验证该企业的银行存款与借款、投资人出资情况以及担保、承诺、信用证、保函等其他事项是否真实、合法、完整的询证性书面文件，满足了单位客户委托会计师事务所对其在银行已开办的各种业务情况的询证需求。