现在的安徽医科大学，本科升学率超过了45%。

基本上，本科升学率能超过60%的，大都是985、211大学。虽然看起来，安徽医科大学的本科升学率不是那么出色。但从安徽省内的角度来看，就不低了，如合肥工业大学、安徽大学等高校的升学率并没有安徽医科大学那么高。在安徽医科大学发布的就业数据中显示，其2020届毕业生超过1300人选择升学，升学率达到了46.94%，而且进入到双一流大学深造的比例超过30%，如华中科技大学、复旦大学、中国科学技术大学、中山大学等。