国家税务总局公告2016年第15号：第二条 增值税一般纳税人（以下称纳税人）2016年5月1日后取得并在会计制度上按固定资产核算的不动产，以及2016年5月1日后发生的不动产在建工程，其进项税额应按照本办法有关规定分2年从销项税额中抵扣，第一年抵扣比例为60%，第二年抵扣比例为40%。

所以自建厂房的进项税可以抵扣，且企业购置的作为无形资产核算的土地使用权，取得的增值税专用发票可以一次抵扣。