北京第六医院本部在交道口，另外还有不只一个分院区。

不知道你是从哪里出发。如果是本部，那就是离北京站最近。不过需要提醒你的是，各高铁站发出的车都是定向的。不是去任何一个站都可以通全国。例如，北京朝阳站发出的车只去沈阳及东北地区，北京南站就是京沪线和天津。所以还是先问清楚再说，这个不是就近就能上车的。

北医六院有两个院区：海淀院区和昌平院区。北医六院海淀院区最近的高铁站为北京西站。北大六院昌平院区离北京北站最近亲打车需要半个小时到达目的地