药学巨著是《本草纲目》，共52卷，明代李时珍此书采用“目随纲举”编写体例，故以“纲目”名书。

序例(卷1、2)相当于总论，述本草要籍与药性理论。卷1“历代诸家本草”，介绍明以前主要本草41种。卷3-4为“百病主治药”，卷5-52为各论，收药1892种，附图1109种。