事业单位年终结转结余的具体操作方法可能根据不同的地区和单位规定有所不同，但一般情况下，可以按照以下步骤进行：

1. 制定年度预算：在财务年度开始之前，事业单位需要制定年度预算，包括收入和支出的计划。

预算应该合理确保单位的正常运转，并留出一定的资金用于结转结余。

2. 收入结算：年度结束时，对事业单位的全部收入进行清点和结算。包括各项收费、项目经费等等。确保所有收入都被正确核算和记录。

3. 支出结算：对全年的各项支出进行清点和结算，包括工资、福利、办公费用、项目开支等。确保支出符合年度预算，并且有相关的凭证和票据。

4. 编制年度财务报表：按照财务会计准则，编制事业单位的年度财务报表，包括资产负债表、损益表和现金流量表。这些报表反映了单位的财务状况和经营成果。

5. 审计和审查：年度财务报表需要经过内部审计和外部审查，以确保财务数据的准确性和合规性。

6. 讨论和决策：在年终财务报表完成后，事业单位的管理层将对结余金额进行讨论和决策。根据单位的具体情况和需求，可以决定如何使用结余资金，比如留作备用资金、投资项目、改进设施等。

7. 结转结余：最后，根据决策结果，将结余资金按照规定进行结转。通常会编制结转结余凭证，并将结余金额从财务账户的损益类科目转入资本类科目中。