企业取得的增值税进项发票抵扣联应该按月装订，并保存完整，以备税务人员的检查。

而企业开出发票的存根联应该以一次购买的份数为单位装订成册，（也就是说一次买回25份或50份，则按25份或50份装订）妥善保管。封面还没有具体的规定，可以自制，也可以咨询税务局。