内蒙古医科大学目前有呼和浩特校区和巴彦淖尔校区两个校区。

选择哪个校区作为"好"的判断因素有很多，取决于个人的需求和喜好。

以下是一些可以考虑的因素：

1. 学科专业：了解每个校区提供的专业和学科设置，看看哪个校区的专业更符合你的学习和职业发展目标。

2. 毕业生就业情况：了解每个校区毕业生的就业率和就业质量，了解学校的就业服务和支持机构。

3. 教育资源：考虑每个校区的图书馆、实验室、教室等教育资源的质量和数量。

4. 校园环境：参观校园，了解每个校区的校园环境、设施和生活条件，看看哪个校区更适合你的喜好。

5. 综合评价：了解学校的声誉、排名、学术研究水平等方面的综合评价，可以参考外部的评级机构或学生的评价。最好的校区取决于个人的需求和喜好，建议你在选择之前多方了解和比较，以便作出最合适的决策。

呼和浩特校区最好

内蒙古医科大学有三个校区，分别是巴彦淖尔校区、呼和浩特校区和赤峰校区。

其中，呼和浩特校区最为著名，并且拥有更好的硬件设施和教学资源，因此被认为是最好的校区。