在杀灭的时候会有一定困难，最主要的杀灭方式是选择高温蒸汽，是将食物加热后才可以杀灭的一种病原微生物，温度有可能达到120度左右的时候，才可以把芽孢菌杀灭掉，食品也才能长期的保存。

1、高温：在通过超过100度的高温至少30分钟后，大多数芽孢可以被有效杀灭。

2、辐照：通过辐照方法，也能够彻底杀灭芽孢。