会计两个核算制度是权责发生制和收付实现制。

1.概念不同：权责发生制是相对于收付实现制而言的。权责发生制是按照收益、费用是否归属本期为标准来确定本期收益、费用的一种方法。收付实现制是按照收益、费用是否在本期实际收到或付出为标准确定本期收益、费用的一种方法。

2. 弊端不同：权责发生制的优点是科学、合理、盈亏的计算比较准确，但缺点比较复杂;收付实现制的优点是处理手续简便，缺点是不科学，对盈亏计算不准确。

3. 使用范围不同：根据我国《企业会计准则》规定，我国企业都采用权责发生制，但我国的行政单位仍然普遍采用收付实现制。随着行政事业单位会计制度的改革和完善，收付实现制必然将会被权责发生制所取代

会计上的两种不同的核算制度分别为权责发生制，收付实现制。