高升专函授的档案应该存放在以下地方：具有档案管理权限的工作单位 。

如国企、央企等。当地人才交流中心或人事局 。户口所在地街道办进行保存 。但是需要收取一定的手续费，且不利于以后的调档。人才中心 。可以让学校将函授档案邮寄到人事档案存放的人才中心，再去人才中心办理合并存档手续。自己手中 。需要将找有档案管理权限的机构办理档案激活，然后合并存档，存入人才中心。

高升专函授的档案应该放到学校或教育机构指定的地方，例如学校的教务处或学籍管理部门。如果没有特别规定，可以将档案存放在自己的个人档案中，并妥善保管。